基隆海科館位於基隆市東側的八斗子地區，西鄰八斗子、碧砂漁港、東接東北角海岸風景特定區，有台2線（濱海公路）及台鐵鐵路深澳支線經過。現有建館基地約有48公頃，依山傍海，環境十分優美。
　
基隆海科館也正位於基隆、九份、金瓜石及瑞芳、平溪風景區位置樞紐，即為「大東北角風景帶」。週邊有碧砂觀光漁港、八斗子漁港、漁村、濱海公園、海灣等，還有海洋關單位─漁業署、水產試驗所、海洋大學、台灣國際造船股份有限公司基隆廠、基隆市政府、基隆區漁會等；並集結園區景點、週邊觀光資源及海灣、水下遊憩等項目，成為一個以海洋為主題的教育休閒觀光園區與基隆最大的活動場所。
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